そのときにレンダリングでQuitckTime形式、いわゆるMOVでレンダリングするときのオプションで一番圧縮形式が効率的(画質が綺麗でファイルサイズが小さい)と思われるのがSorensonVideo3です。
このMOV形式でレンダリングするときにSorensonVideo3の圧縮形式を表示するにはQuickTimeの設定を変更してあげると表示されるようになります。
QuickTimeのメニューから編集→設定→QuickTime設定でオプション設定画面を表示ます。
表示されたオプションの詳細タブでメディアエンコーディングのところにチェックをONにします。
このチェックをONにしてあげるとMotionBuilderでMOV形式でレンダリングするときの圧縮形式でSorensonVideo3を表示することができます。